চুনতীর নক্ষত্রখচিত আধ্যাত্মিক আকাশের আরেক নক্ষত্র মুফতি হাজী মৌলানা মোহাম্মদ ইউসুফ চুনতীর  জাগতিক ও ধর্মীয় জগতের অধিকাংশ তারকা এবং আলোকিত চুনতীর সিংহভাগ তাঁর সাথে আত্মীয়তার বন্ধনে আবদ্ধ।চুনতীর অভিভাবক আধ্যাত্মিক পুরুষ হযরত মৌলানা আব্দুল হাকিম তার ফুফা জজ ওয়াজিউল্লাহ খাঁন সানী তাঁর ফুফাতো ভাই এবং একমাত্র ভগ্নীপতি। পূর্বেই বলা হয়েছে জনাব সানী তাঁর মামাতো বোন ফরহাতউন্নিসাকে বিয়ে করেন।চুনতীর আধ্যাত্মিক সাধনার আরেক দিকপাল হযরত শুকুর আলী মুন্সেফ তাঁর পিতার চাচাতো ভাই শাহামত আলীর বড় পুত্র।

মৌলানা হাজী ইউসুফ আলী চার পুত্র ও চার কন্যা  সন্তানের জনক। তাঁর প্রথম কন্যা মোছাম্মাৎ ফাতেমা খাতুনকে হযরত আজমগড়ীর চুনতীস্থ প্রধান খলিফা মৌলানা ফজলুল হকের সাথে বিয়ে দেয়া হয়েছিল পরবর্তীকালে তিঁনি শাহ মৌলানা নজির আহমদ সাহেবের পিতা মৌলানা আব্দুল করিম সাহেবের সাথে পরিনয় সুত্রে আবদ্ধ হন।
তাঁর দ্বিতীয় কন্যা মোছাম্মাৎ নুর জাহান খাতুনের স্বামী হযরত বড় মৌলনা সাহেবের নাতি শাহ মৌলানা আব্দুল গনি ছিদ্দিকী তিনি হযরত আব্দুল হামীদ বোগদাদীর খলিফা ছিলেন। তাঁর দাদার ( বড় মৌলানা সাহেবের) কেরামতের উপর ভিত্তি করে কেরামতনামা রচনা করেন।চুনতী হাকিমিয়া মাদ্রাসার প্রথম সেক্রেটারী আব্দুল গনি সিদ্দিকী মৌলানা গোলাম মোস্তফা সিদ্দিকী ও হাজী শামশুল হুদা ছিদ্দিকীর পিতা।